Comprendre les analyses génétiques (ADN) dans la vérification de compatibilité de filiation chez les chevaux PRE

par Eric Houtrelle - éleveurs de PRE en Belgique - www.acamel.com
et Cédric Mullender - Biologie moléculaire - ARSIA - www.arsia.be

 

Depuis janvier 2004, les analyses ADN ont été introduites dans les contrôles de compatibilité de filiation par le stud-book espagnol. C'est nouveau pour beaucoup, et il nous a semblé intéressant de démystifier ces analyses en décrivant des règles pratiques à leur interprétation tout d'abord, et en détaillant plus avant la théorie scientifique s'y rapportant par ailleurs.

1. Un guide pratique d'interprétation des analyses ADN

Lorsqu'une demande de compatibilité de filiation est demandée à un laboratoire d'analyse ADN, les résultats se présentent sous forme d'un tableau semblable à celui-ci :

La première colonne (VHL20, HTG4, ...) reprend les marqueurs / locus microsattelite.  Ce ne sont pas des gènes, ce sont des endroits de l'ADN (génome) de l'individu qui lui sont spécifiques de par leur longueur uniquement.

Pour chaque marqueur, un animal possède 2 allèles (comme pour un gène). Ce sont les 2 colonnes que l'on retrouve pour chaque individu dans le tableau d'analyse de compatibilité. On va déterminer la longueur et cette longueur est transcrite en code lettre, référence internationale. Par exemple O et O pour VHL20 du père. Si le locus peut être homozygote, les deux allèles ont la même valeur. Si le locus peut être hétérozygote, les deux allèles ont une valeur différente.

On parle d'empreinte ou profil génétique qui représente l'ensemble de plusieurs loci microsatellites dont la taille de ses deux allèles est déterminée. Cette taille est annotée selon des valeurs de référence (chiffres ou lettres). Le tableau ci-dessus présente donc 3 empreintes génétiques qu'il convient de comparer : celle du père (à gauche), celle du produit (au centre) et celle de la mère (à droite).

On parle de lien de filiation / descendance directe  si pour chaque locus microsatellite, la descendance possède un des deux allèles provenant du parent (hérédité Mendélienne). Pour les test de filiation, on doit donc retrouver chez la descendance un allèle venant du père et l'autre venant de la mère (caractère héréditaire de Mendel).

Très concrètement, le tableau ci-dessus se présente sous forme de 6 colonnes : 2 pour le père à gauche, 2 pour le produit au centre et 2 pour la mère à droite. La filiation est compatible si, pour chaque ligne, dans les colonnes  du produit (3e et 4e colonne), on retrouve un des  deux éléments des colonnes du père (colonnes 1 et 2)  et un des deux éléments des colonnes de la mère (colonnes 5 et 6).

A noter qu'un lien de filiation est refusé entre deux échantillons lorsqu'au moins deux incompatibilités sont mises en évidence. Une seule incompatibilité ne constitue pas un refus de filiation , mais est clairement signalée lors de l'expertise.

 

2. La mise en évidence de l'ADN, pour les plus scientifiques d'entre vous ...

Nous vous renvoyons à un article de vulgarisation écrit par les scientifiques de l'ARSIA et qui décrit la methode de mise en évidence de l'ADN dans les laboratoires d'analyses génétiques. Cliquez ici pour télécharger l'article.

 

Acaballadero Melchior

E. Houtrelle et N. Melchior
Elevage de chevaux PRE
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